Ich bin über die gleiche Diskrepanz gestolpert und war verwundert über einen signifikanten Unterschied zwischen den beiden Preisen auf ETR und FRA. Zum Beispiel ist heute Sonntag, und google zeigt die folgenden Schlusskurse für DAI.
FRA:DAI :
Date Open High Low Close Volume
Nov 20, 2015 78.55 79.50 78.50 79.36 8,910
ETR:DAI :
Date Open High Low Close Volume
Nov 20, 2015 79.16 79.60 78.60 79.25 3,076,967
Es sieht also so aus, als gäbe es tatsächlich zwei verschiedene Börsen, die zu unterschiedlichen Preisen handeln.
Nun, der wichtige Wert hier, ist die letzte Spalte (Volume). Laut Wikipedia wird der Handel an der Frankfurter Wertpapierbörse heute ausschließlich über die Xetra-Plattform abgewickelt, daher ist das Volumen auf ETR:DAI viel wichtiger als auf FRA:DAI.
Offensichtlich ist diese Wikipedia nicht zu 100% korrekt, d.h. nicht alle Geschäfte werden elektronisch über Xetra abgewickelt. Laut deren Webseite hat die Frankfurter Börse einen Spezialhandel auf dem Frankfurter Parkett Service, der etwas andere Handelszeiten hat.
Ich vermute, dass das, was Google und Yahoo als Börse Frankfurt zeigen, dieser manuelle Handel über einen Spezialisten ist (im Gegensatz zum elektronischen Handel über Xetra).
Um Ihre Frage zu beantworten: Die Aktie, die Sie haben, ist genau die gleiche, d.h. wenn Sie einen ETR:BMW gekauft haben, können Sie ihn immer noch auf FRA verkaufen (indem Sie einen FRA-Handelsspezialisten anrufen, was Sie wahrscheinlich eine Gebühr kosten wird).
Andererseits sollten Sie für die Portfoliobewertung und die Performance-Beurteilung nur ETR:BMW-Kurse verwenden, da diese viel liquider sind und somit die aktuelle Marktbewertung besser widerspiegeln.